Faits marquants
Séquençage et annotation de génomes : les membres du laboratoire BF2I ont été impliqués dans plusieurs projets de séquençage. Ils ont participé au séquençage et à l’annotation du génome du puceron du pois (IAGC, 2010, Wilson et al., 2010, Gerardo et al., 2010), et du génome de la bactérie symbiotique de Sitophilus, Sodalis pierantonius (Oakeson et al., 2014, GBE). Ils sont actuellement en train de coordonner le séquençage du génome de Sitophilus oryzae, en collaboration avec le groupe d’A. Latorre (Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva Universitat de València, Espagne).
Découverte d’un nouveau peptide antimicrobien (ColA) qui est impliqué dans le contrôle du symbiote chez le charançon. Le peptide ColA cible spécifiquement les symbiotes dans les cellules bacteriocytaires, inhibe leur division cellulaire et leur croissance et limite leur espace au bactériome (Login et al., 2011, Science).
Identification des gènes et des voies clés du métabolisme de la symbiose puceron/Buchnera : En combinant des approches métaboliques et transcriptomiques, nous avons identifié une voie clé du métabolisme symbiotique : la voie de la tyrosine (Rabatel et al., 2013). Partagée entre le puceron du pois et son symbiote primaire B. aphidicola, elle régule le développement parthénogénetique de l’insecte. Dans cette voie, nous avons mis en évidence la fonction centrale de la phénylalanine hydroxylase, dont l’inactivation génique affecte sévèrement la fécondité des pucerons et le développement embryonnaire (Simonet et al., 2016, Scientific Reports).
Découverte du nouveau mode d’action d’un bioinsecticide PA1b : nous avons montré que le peptide PA1b cible et bloque la pompe à proton vacuolaire (V type H+-ATPase). Comme l’activité de la V-ATPase est essentielle pour l’absorption des nutriments énergétiques dans l’intestin de l’insecte, l’utilisation de cette nouvelle propriété de PA1b est un moyen prometteur pour lutter contre les insectes nuisibles (Chouabe et al., 2011).
Découverte d’un nouvel homologue de PA1b à haute activité insecticide : les analyses phylogénétiques de PA1b chez Medicago truncatula ont révélé l’existence d’un nouveau homologue de PA1b, nommé AG41. Ce dernier a montré une activité insecticide très forte et inattendue.
Projets financés
- 2020 "Myzus persicae symbiotic interactions impact on host epigenetic landscape" IDEX-FAPESP
- 2020 "Deciphering the mechanisms governing the development and organization of secondary bacteriocytes in aphid symbiosis" SEMAPHORE - F.R.S.-FNRS
- 2019-2023 ANR : "Deciphering the Functional Organization of Cross-kingdom ‘metabolic factories’ in insect endoSymbiosis" (FOCUS)
- 2019-2023 ANR : "Deciphering Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich protein structure and activity: a new potential BIOpesticide FAMILY alternative to conventional chemical treatments" (BIOFAMILY)
- 2019 “IAP Expansion in aphid genomes and their role in the bacteriocyte cell death.” Research Collaborative Project supported by FNRS/KU-Leuven
- 2018-2022 ANR : “Pesticides free-robotized pest control in agriculture” (GREENSHIELD)
- 2018-2022 ANR : “Unravelling the link between epigenetics and insect symbiosis.” (UNLEASH)
- 2018-2022 ANR : “Deciphering host immune gene regulation and function to target symbiosis disturbance and endosymbiont control in insect pests.” (GREEN)
- 2018-2020 “Network on plant-insect-symbiont interactions between France and Japan.” 2RI – International Research Network France/Japan
- 2018 “Micro-Be-Have: Microbial impact on insect behavior: from niche and partner choice to the development of new control methods for pests and disease vectors.” Breakthrough Idex Lyon
- 2018 “RNAseq analyses: bacteriocyte cell death.” Research Collaborative Project supported by FNRS/KU-Leuven
- 2017-2021 ANR : “Host-Microbiota Co-adaptations: Mechanisms and Consequences.” (HMICMAC)
- 2017-2020 “Structural and functional study of the weevil peptidoglycan recognition protein PGRP-LB”, half PhD fellowship (shared with INRA SPE Division) to support the thesis salary Diamond, Oxford.
- 2016-2018 “The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of the sweetpotato whitefly Bemisia tabaci.” Joint Research Projects France – Israel, CNRS/Israel Ministry of Science, Technology and Space.
- 2014 “Hubert Curien (PHC) – Amadeus”
- 2014-2018 ANR : "Immune and Metabolic Control in Intracellular Symbiosis of Insects" (IMETSYM)
- 2013-2017 IAEA coordinated research project : "Enhancing tsetse fly refractoriness to trypanosome infection"
- 2011-2014 ANR : "Evolutionary genetics and mechanisms of plant adaptation in aphids" (SPECIAPHID)
- 2010-2014 ANR : "Immunity and Symbiosis in Arthropods" (IMMUNSYMBART)
- 2009-2011 ANR : "Hortibiope"
- 2008-2011 ANR/BBSRC : "System level analysis of animal metabolism by multicompartment graph- and constraint based modelling" (METNET4SyBio)
- 2008-2011 ANR Génoplante – "Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides" (APHICIBLE)
- 2007-2009 ANR : "Cereal Protect" (Emergence)
- 2006-2010 ANR : "Endosymbiosis in Arthropods" (ENDOSYMBART)
- 2007-2012 Joint FAO/IAEA Division of nuclear techniques in food and agriculture : "Improving SIT for Tsetse Flies through Research on their Symbionts and Pathogens"
- 2005-2010 Ministère des Sciences et de la Technologie Espagnol : "Reductive genome evolution in bacterial endosymbionts of insects"